As águas da região do mangue de Cananéia foram analisadas bacteriológicamente, com o objetivo de estabelecer seu grau de contaminação. As contagens aeróbicas variaram significativamente nas várias épocas, locais e marés, com um máximo de 13.000 bactérias/ml e um mínimo de 21/ml, ao passo que as contagens de coliformes mostraram variação significativa somente segundo os diversos locais com um máximo de 1.600 e um mínimo de 3/ml. O grupo Pseudomonas/Achromobacter abrangeu a mais alta percentagem da flora total com cerca de 60%. As características bioquímicas das linhagens deste grupo são mais sacarolíticas do que proteolíticas, certamente devido ao grande número de diatomáceas presentes.
