Nucleotide sequence alignement of the 5 non coding and structural protein regions of the genome of flaviviruses

Authors

  • Luiz Tadeu M. Figueiredo Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Corina Karen Dost Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Diane Meyre Rassi Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Fátima Pereira M. Celini Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Glauce Lunardelli Trevisan Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Mânlio Tasso O. Mota Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Márcia Cristina T. Ferreira Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Marcos Lázaro Moreli Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Patrícia Cristina G. Pinto Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Renata Dellalibera Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Ricardo Luiz M. Sousa Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
  • Weber Chelli Batista Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo

DOI:

https://doi.org/10.11606/issn.2176-7262.v31i4p610-615

Keywords:

Flavivirus. Dengue. Sequence Alignement. Base Sequence.

Abstract

In this work, it was comparatively analyzed the nucleotide sequences of the genes of the structural proteins C, prM and E of 21 flaviviruses, also including, the 5' non codifier area of the genome. The software DNAsis (Hitachi, Japan) was used for the analysis and a phylogenetic tree of the viruses was built, after the alignment of the nucleotide sequences. In the phylogenetic tree an initial ramification separated the viruses transmitted by ticks of those transmitted by mosquitoes. Also 3 different branches of the phylogenetic tree assembled the dengue viruses, the yellow fever viruses, and the Japanese encephalitis viruses. An evident relationship was observed between the phylogenetic tree and the subgroups and types known on the basis of antigenic relationship.

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Author Biographies

  • Luiz Tadeu M. Figueiredo, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Docente do Departamento de Clínica Médica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo e Coordenador
  • Corina Karen Dost, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo

    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.

     

  • Diane Meyre Rassi, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Fátima Pereira M. Celini, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Glauce Lunardelli Trevisan, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Mânlio Tasso O. Mota, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Márcia Cristina T. Ferreira, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Marcos Lázaro Moreli, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Patrícia Cristina G. Pinto, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Renata Dellalibera, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Ricardo Luiz M. Sousa, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.
  • Weber Chelli Batista, Unidade Multidepartamental de Pesquisa em Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
    Aluno participante do Curso de Pós-Graduação: Resposta Imune nas Infecções por Vírus (RIM-5720), em 1998.

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Published

1998-12-30

Issue

Vol. 31 No. 4 (1998)

Section

Artigo Original

License

 

 

How to Cite

1.
Figueiredo LTM, Dost CK, Rassi DM, Celini FPM, Trevisan GL, Mota MTO, et al. Nucleotide sequence alignement of the 5’ non coding and structural protein regions of the genome of flaviviruses. Medicina (Ribeirão Preto) [Internet]. 1998 Dec. 30 [cited 2024 May 22];31(4):610-5. Available from: https://www.revistas.usp.br/rmrp/article/view/7733